פינוי שברי זכוכית מדירה מציב מספר אתגרים משמעותיים: ראשית, קיים סיכון גבוה לפציעות חמורות בשל החדות והשבירות של הזכוכית. שנית, שברי זכוכית קטנים יכולים להתפזר ולהסתתר במקומות בלתי צפויים, מה שמקשה על איתורם המלא. בנוסף, ישנו הצורך בטיפול מיוחד בפסולת זכוכית, שלא ניתן לפנות באמצעות שיטות פינוי רגילות.
פינוי דירה מוזנחת עם שברי זכוכית דורש גם התמודדות עם זיהום אפשרי וסיכונים בריאותיים נוספים. לבסוף, יש צורך בציוד מיוחד ובידע מקצועי לטיפול בטוח ויעיל בשברי זכוכית בגדלים ובכמויות שונות.