הטיפול באגרנות כפייתית ברחובות מציב מספר אתגרים ייחודיים. ראשית, העיר מאופיינת במגוון אוכלוסיות, מסורתיות ומודרניות, הדורשות גישה מותאמת תרבותית. שנית, הצפיפות העירונית והמבנה הארכיטקטוני של חלק מהשכונות מקשים על
פינוי תכולה בהיקף גדול. בנוסף, יש צורך בהתמודדות עם סטיגמה חברתית, במיוחד בקהילות מסורתיות. אתגר נוסף הוא שיתוף הפעולה עם מערכות הרווחה והבריאות המקומיות לטיפול כוללני. לבסוף, יש להתחשב באקלים החם של האזור, המשפיע על תהליכי הפינוי והניקיון.