שטיפה באקונומיקה לבדה אינה מספיקה לחיטוי יסודי של דירת אגרן. אמנם אקונומיקה היא חומר חיטוי יעיל, אך הבעיה העיקרית בדירות אגרנים היא הגישה המוגבלת למשטחים עקב הצטברות חפצים.
פינוי אגרנות כפייתית הוא שלב הכרחי לפני כל ניסיון חיטוי יסודי. בנוסף, דירות אגרנים לרוב סובלות ממגוון בעיות תברואתיות כמו עובש, טחב, ומזיקים, שדורשות טיפול ספציפי מעבר לשטיפה באקונומיקה. חיטוי יעיל דורש שימוש במגוון חומרים וטכניקות, כולל חומרים נגד עובש, מכשירי אדים חמים, וטיפולי אוזון, בנוסף לניקוי מכני יסודי של כל המשטחים.
