לאחר פינוי הציפורים, מתחיל תהליך מקיף של ניקיון וחיטוי הדירה. ראשית, מתבצע
פינוי גרוטאות ופסולת גסה, כולל קינים, נוצות ולכלוך מצטבר. לאחר מכן, מתבצע ניקיון יסודי של כל המשטחים, כולל קירות, תקרות ורצפות, תוך שימוש בחומרי ניקוי וחיטוי מיוחדים. מערכות האוורור והמיזוג מנוקות ומחוטאות לעומק. שלב חשוב הוא טיפול בריחות, שעשוי לכלול שימוש במכשירי טיהור אוויר וחומרים מנטרלי ריחות. לבסוף, מתבצעת הדברה מקיפה נגד מזיקים שעשויים להיות נוכחים, כמו קרציות או פרעושים. כל התהליך מתבצע תוך שימוש בציוד מגן מתאים ובהתאם לתקנות בטיחות ובריאות.