פינוי מחסן מציב מספר אתגרים ייחודיים. ראשית, מחסנים נוטים להיות עמוסים מאוד, מה שדורש מיומנות רבה ב
סידור דירות ומיון חפצים. שנית, לעיתים קרובות יש צורך בציוד מיוחד ל
פינוי בתים ומחסנים, כמו מלגזות או עגלות מיוחדות, במיוחד כשמדובר בחפצים כבדים או מסורבלים. בנוסף, יש להתמודד עם בעיות של אבק, לכלוך ולעיתים אף מזיקים שהצטברו במחסן לאורך זמן.