ניקוי יסודי של מרפסת לאחר פינוי חפצים הוא שלב קריטי בתהליך השיקום. ראשית, מבוצע
פינוי זבל ופסולת קטנה שנותרה. משתמשים במכשירי ניקוי בלחץ גבוה להסרת לכלוך, אבק ועובש שהצטברו לאורך זמן. מטפלים בכתמים עיקשים עם חומרי ניקוי מתאימים לסוג המשטח. מנקים ביסודיות מעקות, תריסים וחלונות. בודקים ומטפלים בבעיות ניקוז למניעת הצטברות מים. מבצעים חיטוי כללי למניעת התפתחות עובש וחיידקים. לבסוף, מיישמים ציפוי הגנה על משטחים לפי הצורך, כמו איטום לרצפת המרפסת, להגנה מפני נזקי מזג אוויר עתידיים.