תהליך פינוי השורשים על ידי שי פינוי דירה מתחיל בהערכה מקצועית של האתר. צוות מומחה מבצע סקר מקיף של השטח, מזהה את מיקום וגודל השורשים, ובודק את קרבתם לתשתיות. לאחר מכן, מתוכננת אסטרטגיית פינוי מותאמת. התהליך עצמו כולל שימוש בציוד מתקדם כמו מסורי שורשים, כלי חפירה הידראוליים ומכונות גריסה. הצוות חופר בזהירות סביב השורשים, מנתק אותם ממקור הצמיחה, ומוציא אותם מהקרקע. במקרים של
פינוי בתים או שטחים גדולים, משתמשים בציוד כבד נוסף. לאחר הפינוי, מתבצע מילוי וייצוב של הקרקע, וטיפול בכל נזק שנגרם לסביבה.