התנאי הבסיסי לפינוי ירוק הוא הפרדה במקור של הפסולת לזרמים שונים. כבר במהלך הפינוי עצמו, צוות שי פינוי דירה ימיין בקפידה את החפצים – בגדים, רהיטים, ספרים, כלים,
ארגזים וכדומה. כל מה שעוד יכול לשמש ייארז בנפרד ויופנה לתרומה או מחזור במקום למזבלה. חומרים כמו נייר, קרטון, זכוכית ומתכות יופרדו ויועברו למתקני מיון ייעודיים. השאיפה היא למזער את כמות הפסולת המעורבת ולמקסם את ניצול המשאבים.