סידור בתים מוזנחים באשדוד מציב מספר אתגרים משמעותיים. ראשית, ההצטברות של חפצים ופסולת לאורך זמן יכולה להיות עצומה, דורשת זמן ומאמץ רב לפינוי. שנית, בעיות תחזוקה שהוזנחו, כמו נזילות או עובש, עלולות להחמיר ולדרוש טיפול מקצועי. שלישית, הקושי הרגשי בהיפרדות מחפצים, במיוחד אם מדובר באגרנות כפייתית. רביעית, הצורך בתכנון מחדש של המרחב לאחר הפינוי, כולל
סידור דירות באופן פונקציונלי. חמישית, ההתמודדות עם בעיות היגיינה ובריאות שעלולות להתפתח בבתים מוזנחים. שישית, הצורך בתיאום עם רשויות מקומיות או שכנים במקרים של הזנחה קיצונית. לבסוף, האתגר הכלכלי הכרוך בשיקום ושיפוץ הבית לאחר תקופה ארוכה של הזנחה.