תכנון וארגון ניקיון עמוק של דירה מתחיל במספר צעדים חשובים. ראשית, ערכו רשימה מפורטת של כל החדרים והמשימות הנדרשות בכל אחד מהם. שנית, קבעו סדר עדיפויות, מתחילים מהחדרים המלוכלכים ביותר. שלישית, אספו את כל הציוד וחומרי הניקוי הנדרשים מראש. רביעית, הקצו זמן מספיק לכל משימה, כולל הפסקות. חמישית, שקלו לבצע
פינוי פסולת ופריטים מיותרים לפני תחילת הניקיון העמוק. שישית, תכננו את הניקיון בשלבים, למשל יום אחד למטבח ואמבטיה, יום אחר לחדרי שינה וסלון. שביעית, גייסו עזרה אם אפשר, והקצו משימות ספציפיות לכל אדם. לבסוף, תכננו פעילות מהנה או תגמול לאחר סיום הניקיון כמוטיבציה.