זיהום מים מבתים מוזנחים יכול להוביל להשלכות סביבתיות ובריאותיות חמורות. מבחינה סביבתית, הזיהום עלול לפגוע במערכות אקולוגיות שלמות, להרוג דגים וחיות מים אחרות, ולהשפיע על הצמחייה. מבחינה בריאותית, שתיית מים מזוהמים או שימוש בהם עלול לגרום למחלות זיהומיות, בעיות במערכת העיכול, ובמקרים חמורים אף להרעלות. חשיפה ארוכת טווח לכימיקלים במים מזוהמים עלולה להגביר את הסיכון למחלות כרוניות ואף סרטן. בנוסף,
פינוי בית עמוס בחומרים מזהמים הוא הכרחי למניעת זיהום מתמשך.