התמודדות עם הסיכונים הבריאותיים בפינוי לשלשת יונים דורשת זהירות רבה ושימוש באמצעי מיגון מתאימים. צוות שי פינוי דירה מצויד בציוד מגן אישי מתקדם, כולל חליפות מגן, מסכות נשימה עם פילטרים מיוחדים, וכפפות עמידות. לפני תחילת העבודה, האזור המזוהם מבודד למניעת פיזור אבק וחלקיקים. משתמשים בשיטות ניקוי "רטובות" להפחתת פיזור חלקיקים באוויר. כל הציוד והחומרים המשמשים לפינוי עוברים
פינוי פסולת מבוקר ובטוח. לאחר הפינוי, מבצעים חיטוי יסודי של האזור עם חומרים מיוחדים להשמדת חיידקים ופטריות. הצוות עובר הדרכות קבועות בנושאי בטיחות וגהות, ומתבצעות בדיקות רפואיות תקופתיות לעובדים החשופים ללשלשת יונים באופן קבוע.